Voici la solution que j'ai retenue, grâce à ce message: https://discourse.joplinapp.org/t/watching-for-external-edits-stops-in-linux/2541/2
Path: gvim
Arguments: -c 'set backupcopy=yes'
Je garde ce qui suit au cas où mais préférer la première solution
Pour utiliser vim dans un gnome-terminal comme éditeur externe dans Joplin, dans options > General:
Path: gnome-terminal
Arguments: -- vim
Pour utiliser xfce4-terminal (mais j'ai un vieux bug d'affichage, certaines parties du fichier ne s'affichent que lorsque je sélectionne les lignes):
Path: /usr/bin/xfce4-terminal.wrapper
Arguments: -e vim -c 'set backupcopy=yes'