Pour utiliser certains composants personalisés (serveur d'intégration perso, ...) dans la version de bureau d'Element il faut créer le fichier de config ~/.config/Element/config.json (%APPDATA%/Element/config.json pour Windows)

J'y ai mis le même contenu que celui du client web Element sur mon serveur Matrix (/matrix/client-element/config.json).

EDIT: d'après ce que j'ai lu sur #matrix-docker-ansible-deploy:devture.com c'est du au fait que je me suis connecté avant d'avoir mis en place mon serveur d'intégrations. Logiquement sur la prochaine machine ou j'installerai l'application je n'aurai plus le problème.